МСЧ с функцией ВЛЭК была создана в 2009г. и является структурным подразделением филиала «Аэронавигация Центральной Сибири» ФГУП «Госкорпорация по ОрВД».

МСЧ функционирует в соответствии с Положением  о МСЧ и имеющейся лицензией и сертификатом на право осуществления специализированной медицинской деятельности: врачебно-лётной экспертизы, экспертизы профессиональной пригодности, медицинских осмотров (предварительных, периодических), проведении медицинских освидетельствований на наличие медицинских противопоказаний к управлению транспортным средством, медицинскому освидетельствованию на наличие медицинских противопоказаний к владению оружием, первичной медико-санитарной помощи по медицинским осмотрам (предполётным, послеполётным, предрейсовым, послерейсовым) по неврологии, оториноларингологии, офтальмологии, терапии, хирургии, акушерству и гинекологии, клинической лабораторной диагностике, стоматологии общей практики, экспертизе временной нетрудоспособности, осуществление амбулаторно-поликлинической медицинской помощи по функциональной и ультразвуковой диагностике.

Основные задачи медицинской деятельности МСЧ с функцией ВЛЭК сводятся к обеспечению высокой надёжности лётного труда, здоровья авиаспециалистов, продлению лётного долголетия, повышению работоспособности авиационного персонала, а также наземного технического персонала.

Важное место в системе медицинского обеспечения полетов занимает врачебно-летная экспертиза, проводящая медицинское освидетельствование авиаспециалистов в рамках общегосударственной системы сертификации.